所谓实时荧光定量PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

一、检测方法：

1.SYBRGreenⅠ法：

在PCR反应体系中，加入过量SYBR荧光染料，SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加同步。

2.TaqMan探针法：

探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收；PCR扩增时，Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解，使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离，从而荧光监测系统可接收到荧光信号，即每扩增一条DNA链，就有一个荧光分子形成，实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成*同步。

二、通用原则：

1，先选择好探针，然后设计引物使其尽可能的靠近于探针。

2， 扩增子的长度应不超过400bp，理想的能在100－150bp内，扩增片断约短，有效的扩增反应就越容易获得。较短的扩增片断也容易保证分析的一致性

3， 保持GC含量在20％和80％之间，GC富含区容易产生非特异反应，从而会导致扩增效率的降低，及在SG分析中非特异信号。

4， 为了保证效率和重复性，应避免重复的核苷酸序列，尤其是G（不能有4个连续的G）

5， 将引物和探针互相进行配对检测，以避免二聚体和发卡结构的形成。

b），探针设计指导

1，在设计引物之前设计探针

2，探针的Tm值应在68－70℃之间，如果是目测探针，则要仔细审查GC富含区。

3，探针的5’端要避免有鸟氨酸，5’G会有淬灭作用，即使被切割下来这种淬灭作用也还会存在

4，选择C多于G的链作探针，G的含量多于C会降低反应效率，这时就应选择配对的另一条链作为探针。

6， 探针应尽可能的短，不要超过30个bp。

7， 检测探针的DNA折叠和二级结构。