BTN90603C 随机引物法DNA探针地高xīn标记试

产品简介
北京百奥莱博供应的随机引物法DNA探针地高xīn标记试用于科研试验,本产品质量好,且具价格,深为用户称道,了解更多随机引物法DNA探针地高xīn标记试等探针标记及检测产品请联系我司咨询订购。...
产品详细介绍
特别提示:包括随机引物法DNA探针dì高辛标记试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:随机引物法DNA探针dì高辛标记试剂盒
英文名称:Random Primer DNA Labeling Kit(Digoxin)
产品货号:BTN90603C
产品规格:5次
本试剂盒是基于Feinberg和Vogelstein发明的随机引物标记法而开发出来的即用型DNA探针标记试剂盒,标记过程由双链DNA热变性、随机引物与单链DNA结合、在Klenow DNA聚合酶催化下,引物的延伸合成DNA探针并掺入标记的核苷酸三步组成,可用下面的示意图表示:

本产品对Feinberg和Vogelstein经典方法进行了改良。
产品特点:
1. 提供的标记反应液整合了除酶和模板外的所有成分,简化了反应加样步骤,提高了标记反应的可重复性。
2. 使用无外切活性的Klenow exo- DNA聚合酶,已标记DNA探针不会被酶降解。
3.快速,zuì快1小时即可完成标记反应。
4. 得到的DNA探针比活性高(如果是同位素,可以达到109cpm/μg DNA),检测灵敏度高。
5. 所需模版DNA量少(只需要10ng以上即可),DNA可以是各种形状(线状和环状)的、也可以是单链或双链的,长度在100bp以上均可。
6. 得到的探针长度在200-400nt之间,可以用于Southern杂交、Northern杂交、原位杂交、菌落和斑点印迹杂交等。
7. 提供三种标记选择,其中BTN90603A可用于各种同位素标记和其他任何非同位素标记,但需自备标记底物;BTN90603B和BTN90603C可分别用于生物素和dì高辛标记,不需自备标记底物。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| 2×A型标记反应液(自备标记物型) | 50μl(仅A型有) |
| 2×B型标记反应液(生物素型) | 50μl(仅B型有) |
| 2×C型标记反应液(DIG型) | 50μl(仅C型有) |
| dATP,2mM | 10μL(仅A型有) |
| dTTP,2mM | 10μL(仅A型有) |
| dGTP,2mM | 10μL(仅A型有) |
| dCTP,2mM | 10μL(仅A型有) |
| Klenow exo-聚合酶(2U/μL) | 5μl |
| 超纯水 | 1ml |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
1.在一干净的硅化的塑料离心管中加入下列成分:
| 成分 | 用量 |
| 模板DNA | 50-150ng |
| 2×标记反应液(ABC三种之一) | 10μl |
| 超纯水 | 补水到15μl |
注意:非同位素标记物由于疏水性强,容易与常用的塑料离心管表面非特异性结合,所以一定要使用硅化的塑料离心管。模板DNA并非越多越好,因为模板会在杂交反应中跟标记的探针杂交,竞争性地抑制探针跟靶分子的杂交。
2. 沸水浴5-10分钟,或在PCR仪上100℃加热5-10分钟使DNA模版充分变性,立即放冰上待用。注意:如果PCR仪器不能设置到100℃,99℃加热5分钟也可。
3.高速离心数秒使所有液体集中在管底,根据试剂盒类型加入下列成份:
| 试剂盒类型 | 成分及用量 |
| BTN90603A型 |
dATP、dGTP、dCTP各1μl(共3μL,浓度均为2mM) 自备的2mM dTTP/标记dUTP混合物(见注)1μL 1μl Klenow exo聚合酶 |
| BTN90603B型 |
1μl Klenow exo聚合酶 4μl超纯水 |
| BTN90603C型 |
1μl Klenow exo聚合酶 4μl超纯水 |
注:上表中的dTTP/标记dUTP混合物中dTTP和标记的dUTP的总浓度为2mM(在20μL体系中混合液的终浓度为0.1mM,dTTP与生物素或DIG标记的dUTP的比例zuì好为65:35)。由于空间阻碍,并非标记生物素或DIG标记的dUTP越多灵敏度越高,一般dTTP与标记dUTP的比例在65:35为zuì佳。但如果使用自备的其他标记核苷酸,如fluorescein、hydroxycoumarin、resorufin和aminoallyl标记的dUTP,则用户需要自己摸索其与dTTP之间的zuì佳比例,如果使用32P标记的dUTP,则比活zuì好为3000Ci/mmol,浓度为好为10uCi/μL,并且不需要加入dTTP。
4. 轻柔吹打混匀。如有液滴沾在管壁上,高速离心数秒使所有液体集中在管底。
5. 37℃保温1-20小时。标记效率跟模版量和保温时间相关,具体见下表:
| 模版DNA用量 | 1小时后探针合成量 | 20小时后探针合成量 |
| 10ng | 80ng | 900ng |
| 30ng | 150ng | 1.35μg |
| 100ng | 350ng | 1.65μg |
| 300ng | 750ng | 2.2μg |
| 1μg | 1.3μg | 2.6μg |
| 3μg | 1.6μng | 2.6μg |
6. 加1μl自备的0.5M EDTA(pH8.0)终止反应,立即放冰上待用或放-20℃保存一年。用前需要加热100℃ 5分钟使DNA探针变性成单链,然后直接加入到杂交反应液中即可。如果电泳检测,标记产物将是弥散状态。
注意:本方法标记核苷酸掺入率高,因此可以不经纯化直接使用。如果需要纯化,注意不要用酚抽提法纯化非同位素(生物素、DIG和其他等)标记的DNA探针,因为这些标记分子疏水性强,能使标记的DNA进入疏水的有机相而丢失,但可以用乙醇沉淀和Sephadex G50回收(可另购非同位素探针柱式纯化试剂盒)。对比活高的同位素探针,由于其其不稳定,因此应该立即使用,不要长久放置。
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名称:5′末端同位素标记试剂盒
货号:BTN131036
规格:20次
本产品为DNA 5′末端标记系统,利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 对粘性末端或平末端的DNA或RNA的5′末端进行标记反应。原理如下:

产品特点:
1. 使用本试剂盒之前,不需要对 5′末端的磷酸基团进行去磷酸化处理,因为使用的kinase 能使5′末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。
2. 合成的单链或双寡核苷酸的5′末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。
3. 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能进行,均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。
试剂盒组份:
| 成分 | 规格 |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 20μl |
| 5×交换反应缓冲液 | 100μl |
| 10×磷酸缓冲液 | 50μl |
|
Co | 20μl |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、交换反应
1. 实验前需自备的试剂:7 M 醋酸铵、乙醇、70%乙醇等
2.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的5′磷酸化DNA片段 | 14μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 5×交换反应缓冲液 | 5μL |
| [γ-32P]ATP | 5μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
注:5 pmoles的5′末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。
3. 37℃反应30分钟。
4. 70℃加热5~10分钟使酶失活。
5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。
6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
7.离心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
8. 用适当 Buffer 溶解沉淀。
注:通过第5~8 步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP,如要完全将其除去时,乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用苯酚抽提除去蛋白质时,请在第8 步之后进行。
二、磷酸化反应标记
A. 去磷酸化反应
1. 实验前需自备的试剂:TE 饱和酚/lǜ仿、3 M NaCl 、乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等
2.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的DNA片段 | 133μL(≤10μg) |
| 1M Tris-HCl,pH8.0 | 15μL |
| 牛小肠碱性磷酸酶(CIAP,10~20U/μL) | 2μl |
| 灭菌的超纯水 | 补足到150μL |
3. 50℃反应30分钟。
4. 加入150μl的TE 饱和酚/lǜ仿/异戊醇(25:24:1),充分混匀。
5.离心,取上层(水层)移到另一个微量离心管中。
6. 重复操作 4~5。
7. 加入7.5μl的3 M NaCl(zuì终浓度150mM)。
8. 加入375μl(2.5倍量)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
9.离心回收沉淀,用 1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。
B. 磷酸化反应(前反应)
1.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
| 自备的DNA片段 | 20.5μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 10×磷酸缓冲液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
2. 37℃反应30分钟。
3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。
三、合成DNA 寡核苷酸的标记
1.在微量离心管中制备下列反应液:
| 成分 | 加入的体积 |
|
Oligo | ≤3μL |
| 10×磷酸缓冲液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 灭菌的超纯水 | 补足到25μL |
2. 37℃反应30分钟。
3.下面的操作与交换反应的第4-8 步操作相同。
四、合成DNA 寡核苷酸的标记
当掺入水平很低的时候,需要使用本步骤,即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G-50 层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好,它还能大幅减少小于20个碱基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5~10分钟以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。
注意事项:
1.缓冲液可在室温融解。融解后立即置于冰中,使用前充分混匀。
2. 5×交换反应缓冲液于-20℃冻结保存时会有白色浑浊出现,但不影响反应效果。
3.酶切得到的DNA片段需经乙醇沉淀等方法纯化。
4. 当用于交换反应的DNA在5 pmoles以上(约1,000bp以上)时,标记效率有时会低于106 cpm/pmol。
5. 如果交换反应所用 DNA低于500bp时,标记效率有时会有所降低。
6. 若不进行放射线标记,仅使用本试剂盒做5′末端磷酸化反应时,反应体系中的[γ-32P]ATP可用5μl的10mM ATP 代替。
7. 磷酸化反应时的[γ-32P]ATP可用[γ-35S]ATP 替代。
使用举例:
按照使用方法中交换反应和合成DNA 寡核苷酸的标记的实验操作,取λ-BstP I,λ-Hpa I,λ-EcoT22 I 各3 pmols,用[γ-32 P]ATP 通过正向磷酸化反应或交换反应标记。各DNA片段的放射自显影结果如下所示:

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