WH0199 DNA分选纯化磁珠

产品简介
北京百奥莱博供应的DNA分选纯化磁珠用于科学研究,本产品质量好,且具价格,深为用户称道,了解更多DNA分选纯化磁珠等DNA提取纯化产品请联系我司咨询订购。...
产品详细介绍
特别提示:包括DNA分选纯化磁珠在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:DNA分选纯化磁珠
英文名称:DNA Size Selection Beads
产品货号:WH0199
产品规格:15ml|60ml|300ml
本制品是一款可以用于DNA片段分选和DNA产物纯化的核酸纯化产品。采用高性能磁珠和独特缓冲液体系,通过调整磁珠与样本的比例,无需割胶即可实现100 bp~1000 bp的双链及单链DNA片段的分选及纯化。使用本试剂盒可有效去除反应体系中的dNTP、盐离子及有机杂质等,所得DNA片段纯度高,回收效率可达90%以上。可广泛应用于NGS文库构建中特定长度DNA片段的分选与纯化。
产品特点:
·:DNA片段纯化得率高,效率可达90%。
·简便:无需割胶,自由选择所分选DNA片段的长度。
·兼容:兼容手工操作或自动化工作站的高通量操作。
适用范围:
高通量测序文库构建中DNA片段的分选及纯化,PCR反应体系、酶切及连接反应体系中DNA的纯化,游离核酸筛选,核酸提取过程中小片段DNA的去除等。
产品组成:
组分 | WH0199-1 | WH0199-2 |
磁珠结合液DM | 15ml | 4×15ml |
洗脱缓冲液TB | 15ml | 2×15ml |
储存条件:2-8℃保存一年。
注意事项:请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。
1.磁珠结合液DM于4℃储存,避免冻存,实验前将磁珠结合液DM从4℃取出,室温放置20分钟使磁珠平衡至室温。
2.由于部分反应体系中的成分可能会对分选片段的长度产生影响,因此需要根据具体情况调整所加入磁珠的体积。
3.纯化小的DNA片段(≤200bp),可加入1.4倍或1.8倍的磁珠结合液DM进行纯化回收,提高回收效率。
4.所使用的80%乙醇需自行准备,建议现用现配,且在使用80%乙醇进行洗涤的过程中,不要将试管从磁力架上转移。
DNA浓度及纯度检测:
纯化回收的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和DNA Chips检测浓度与片段大小。
操作步骤:
一、DNA片段分选步骤
本操作步骤适合酶切处理或超声打断基因组文库构建过程中片段的分选和纯化。
1.将平衡至室温的磁珠结合液DM振荡混匀,取适当体积的磁珠结合液DM加入待分选的DNA片段中充分混匀(加入磁珠结合液DM的体积可参照表1),室温静置5min (期间混匀一次)。
表1:DNA片段分选推荐磁珠结合液DM用量
打断片段平均长度(bp) | ~100 | ~200 | ~300 | ~480 | ~780 | |
文库片段平均长度(bp) (打断片段+接头) | ~220 | ~320 | ~420 | ~600 | ~900 | |
磁珠用量 | 次筛选 | 0.7倍 | 0.6倍 | 0.5倍 | 0.4倍 | 0.3倍 |
第二次筛选 | 0.1倍 | 0.1倍 | 0.1倍 | 0.1倍 | 0.1倍 |
2.瞬时离心将溶液离心至管底,将离心管放置于磁力架上静置2~5min,待磁珠完全吸附后转移上清至新的离心管中(切勿吸到磁珠,建议留存2~3μl上清),弃磁珠。
3.加入转移上清体积0.1倍的磁珠结合液DM,充分混匀后室温静置5min(期间混匀一次)。
4.将离心管放置于磁力架上吸附2~5min,待磁珠完全贴壁后,用移液器小心去除上清。
注意:步骤4、5和6均需在磁力架上操作,切勿将离心管从磁力架上移开。
5.向步骤4的离心管中加入200 μl 80%乙醇溶液(现用现配),轻轻吹打3~5次(不要吹打磁珠),磁力架上静置2 min,用移液器小心去除上清。
6.重复步骤5一次。
7.用移液器尽量去除液体,室温晾干2~5min,将离心管从磁力架上取下,加入25 μl洗脱缓冲液TB,用枪吹打3~5次充分混匀,室温静置3~5min。
注意:磁珠在室温晾干切勿超过5min,过度干燥严重影响洗脱效率,45℃加热洗脱可以提高洗脱效率。
8.将离心管放置于磁力架上静置2~5min,待磁珠完全吸附后,将上清转移至一个新离心管中,并于适当条件保存,或直接用于NGS文库构建的PCR富集反应。
二、PCR富集后文库的纯化步骤
1.向PCR反应产物中加入1倍体积的磁珠结合液DM充分混匀,室温静置5min (期间混匀一次)。
2.将离心管放置于磁力架上吸附2~5min,待磁珠完全吸附后,弃上清。
注意:步骤2、3和4均需在磁力架上操作,切勿将离心管从磁力架上移开,切勿吹散磁珠。
3.离心管放置于磁力架上,加入200 μl 80%乙醇溶液(现用现配),轻轻吹打3~5次(不要吹打磁珠),磁力架上静置2~5min,小心吸弃上清。
4.重复步骤3一次。
5.用移液器尽量去除液体,室温晾干2~5min,将离心管从磁力架上取下,加入适当体积的洗脱缓冲液TB,用枪吹打3~5次,室温静置3~5min。
注意:磁珠在室温晾干切勿超过5min,过度干燥严重影响洗脱效率,45℃加热洗脱可以提高洗脱效率。
6.将离心管放置于磁力架上静置2~5min,磁珠完全吸附后,将上清转移至一个新离心管中,并于-20℃保存。
三、无需分选的DNA纯化步骤
本操作步骤适合于无需片段分选的文库构建过程中DNA的纯化(如游离核酸测序文库等)。
1.将DNA溶液转移到1.5ml离心管中,将磁珠振荡混匀,加入1倍体积的磁珠结合液DM充分混匀,室温静置5min(期间混匀一次)。
2.将离心管放置于磁力架上静置2~5min,待磁珠完全吸附后弃上清。
注意:步骤2、3和4中切勿将离心管从磁力架上移开,切勿吹散磁珠。
3.将离心管放置于磁力架上,加入200 μl 80%乙醇(现用现配),轻轻吹打3~5次(不要吹打磁珠),磁力架上静置2~5min,小心去除液体。
4.重复步骤3一次。
5.用移液器尽量去除液体,室温晾干2~5min,将离心管从磁力架上取下,加入25 μl洗脱缓冲液TB,用枪吹打3~5次,室温洗脱3~5min,转移上清至新的离心管中,于适当条件保存,或直接用于NGS文库构建的PCR富集反应。
注意:磁珠在室温晾干切勿超过5min,过度干燥严重影响洗脱效率,45℃加热洗脱可以提高洗脱效率。
6.PCR富集后文库的纯化参照步骤二。
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试剂盒组成:
组份 | 50次 |
Buffer P1 | 15ml |
Buffer P2 | 15ml |
Buffer N3 | 20ml |
Buffer PS | 15ml |
Buffer PB | 10ml |
Buffer PW(浓缩液) | 10ml |
Buffer EB | 10ml |
RNase A(10 mg/ml) | 150μl |
玻璃珠 | 2g |
吸附柱DM及收集管 | 50套 |
自备试剂:无水乙醇,异丙醇。
实验前准备及重要注意事项:
1、所有组分可在干燥、室温(15~30℃)环境稳定保存1年,将吸附柱置于2~8℃可保存更长时间,加入RNase A的Buffer P1 置于2~8℃可稳定保存6个月。
2、次使用前,将RNase A溶液全部加入到Buffer P1中,混匀,置于2–8℃保存。
3、次使用前应按照试剂瓶标签的说明先在Buffer PW中加入无水乙醇。
4、使用前请检查Buffer P2、Buffer N3是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀现象,可在37℃水浴几分钟,即可恢复澄清。
5、注意不要直接接触Buffer P2和Buffer N3,使用后应立即盖紧盖子。
6、提取的质粒量与酵母菌株、质粒拷贝数、培养条件等因素有关,通常酵母质粒拷贝数都很低,通过电泳或分光光度计法都很难检测到。
操作步骤:
1、取1-5ml酵母培养物(zuì多不超过5×107个酵母细胞,一般对于酿酒酵母OD600=1.0时,相当于1-2×107细胞/ml)加入离心管(自备)中,12000rpm(~~13400×g)离心30秒,收集菌体沉淀,尽量吸弃上清。
2、向菌体中加入250μl Buffer P1(请先检查是否已加入RNase A),重悬沉淀。
3、在以上混合物中加入40 mg的玻璃珠(Glass Beads),涡旋震荡10分钟。
4、向离心管中加入250μl Buffer P2,温和地上下颠倒混匀6-8次,室温放置5-10分钟,此时菌液应变得清亮粘稠。
注意:温和混匀,不要剧烈震荡,以免打断基因组DNA,造成提取的质粒中混有基因组DNA片段。如果溶液未变得清亮,提示可能菌量过大,裂解不彻底,应减少菌体量。
5、向离心管中加入350μl Buffer N3,立即温和地上下颠倒混匀6-8次,此时出现白色絮状沉淀,12000rpm离心20分钟。
注意:Buffer N3加入后应立即混匀,避免产生局部沉淀。
6、柱平衡: 向已装入收集管的吸附柱DM中加入200μl Buffer PS,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7、将步骤5所得上清加入到已装入收集管的吸附柱中,注意不要吸出沉淀。
注意:吸附柱的zuì大容积为750μl,溶液分2次过柱。
8、12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
9、向吸附柱加入150μl Buffer PB,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
10、向吸附柱中加入750μl Buffer PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液。
11、将吸附柱重新放回收收集管中,12000rpm离心2分钟,倒掉废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。
12、将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-100μl Buffer EB,室温放置数分钟,13000rpm离心1分钟,将质粒溶液收集到离心管中。-20℃保存质粒。
注意:
1)为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置数分钟,13000rpm离心1分钟,将质粒溶液收集到离心管中。
2)质粒拷贝数较低或>10 kb时,Buffer EB在65-70℃水浴预热,可以增加提取效率。
3)通常酵母质粒拷贝数很低,通过电泳或者分光光度计法都很难检测到。提取的质粒如果用于下一步实验,通常建议使用量为:用作PCR模板可使用1–5μl质粒,用于转化大肠杆菌可使用5–10μl质粒。
4)转化大肠杆菌时应使用商业化高转化效率的感受态细胞。
储存条件:室温(15~30℃)
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