BTN100903 AFLP试剂盒

产品简介
北京百奥莱博供应的AFLP试剂盒仅用于生物化学研究方面,AFLP试剂盒是我司众多优质基因结构和功能之一,质量堪比同类进口产品,价格非常优惠,目前正热烈促销中,恭候您的咨询订购。...
产品详细介绍
特别提示:包括AFLP试剂盒(EcoRI-MseI)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:AFLP试剂盒(EcoRI-MseI)
英文名称:AFLP Kit(EcoRI-MseI)
产品货号:BTN100903
产品规格:1600次
本产品在传统AFLP-PCR的基础上经过精心优化而开发。AFLP(amplified fragment length polymorphism)原理是一种结合RFLP和PCR技术特点的、迄今为止zuì有效分子标记分型技术,其原理如下:

产品特点:
1.一站式,足够50次酶切-连接反应、50次预扩反应和1600次AFLP PCR(PCR按30μL体系计算),但不包括DNA 纯化和带型分析试剂(如PAGE电泳试剂和银染试剂)。
2.本系列产品提供EcoRI-MseI 组合,适用于GC含量在50%以上的基因组。对GC含量在50%以下的基因组,需从本公司采购AFLP(EcoRI-TaqI)组合。
3.各种参数都经过优化,一次PCR所得AFLP片段数一般在10-100之间,可重复性好,误差小于0.6%。
4.本产品适用于基因组在500 Mb-6000Mb的材料(如动物和植物),对于基因组在50-500Mb的材料(如细菌和真菌)或50Mb以下的材料(如质粒,cosmid,BAC,YAC和PAC等),需要分别另购专门的+1型预扩引物混合液和+3型EcoRI引物(8 种)AFLP引物对。
试剂盒组成:
成分 | 规格 |
酶切-连接Buffer,10× | 100μl |
EcoRI-MseI酶混合液 | 100μl |
EcoRI-MseI 接头混合物 | 1ml |
T4 DNA连接酶(1U/μL) | 50μl |
+0型预扩引物混合液 | 750μl |
PCR Mix 3.0 | 9ml×3 |
对照DNA(50ng/μL) | 20μl |
+2型EcoRI引物(8条) | 1ml每种 |
+3型MseI引物(8条) | 1ml每种 |
TE溶液,pH8.0 | 10ml |
超纯水 | 10ml |
说明书 | 1份 |
+2型EcoRI引物和+3型MseI引物zuì后碱基的序列
引物名称 | 8条引物3′zuì后碱基 |
+2型EcoRI引物 | -AA,-AT,-AG,-AC,-TA,-TT,-TG,-TC |
+3型MseI引物 | -CAA,-CAC,-CAG,-CAT,-CTA,-CTC,-CTG,-CTT |
储存条件:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂:Southern级DNA纯化试剂,尿素-PAGE电泳套装,银染试剂盒。
使用方法:
一、DNA提取(本试剂盒不提供相关试剂)
用户需要自备50-500ng Southern级别的基因组DNA,用前zuì好预实验以确保DNA能够被EcoRI和MseI内切酶彻底切开。
二、限制性酶切和接头连接反应(本试剂盒足够50次本反应)
1.在0.2mL离心管中加入设置20μL的限制性内切酶酶切体系:
成分 | 用量 |
酶切-连接Buffer,10× | 2μl |
样品DNA |
50ng(对小基因组材料) 500ng(对大基因组材料) 如果用对照,则用5μL |
EcoR I-Mse I酶混合液 | 2μl |
超纯水 | 加水到20μl |
2.轻柔混匀并短暂离心后,37℃保温2小时酶切(若PCR 仪器不带热盖,则必须加50μL自备石蜡油,否则水分会蒸发影响反应。下同),70℃保温15分钟灭活内切酶。
3.在上述酶反应体系中加入20μl EcoRI-MseI 接头混合物和1μl T4 DNA连接酶,轻柔混匀并短暂离心后,20℃保温2小时让接头跟DNA片段相连。
4.在一个离心管中加入10μl上步得到的连接反应液和90μL TE缓冲液,pH8,充分混匀,得到酶切-连接反应10倍稀释液,未用完的酶切-连接反应原液(30μL)可放-20℃保存。
三、预扩增(本试剂盒足够50次本反应)
5.在0.2mL离心管中设置30μl的PCR 体系:
成分 | 体积 |
酶切-连接反应液10倍稀释液 | 5μl |
+0型预扩引物混合液 | 10μl |
PCR Mix 3.0 | 15μl |
6.离心数秒,按下列参数进行PCR预扩增:
温度 | 时间 | |
PCR(20次) | 94℃ | 30s |
56℃ | 60s | |
72℃ | 60s |
7.可以取10μl PCR产物在1.5%琼脂糖胶上电泳检测,产物为100-1500bp 模糊条带。
8.将剩下的预扩反应液用TE 稀释50倍,直接用于下步反应或放-20℃保存待用。
四、选择性PCR扩增(本试剂盒足够至少1600次本反应)
9.在0.2mL PCR 管中,加入下列成分(如果用户已经知道哪个一种或几种引物组合适合自己的材料,则直接使用;如果不知道,则需要预先测试所有64 种组合,设置64个PCR反应),下面只是一种组合:
成分 | 体积 |
预扩反应液50倍稀释液 | 5μl |
+2型EcoR I引物之一(八种之一) | 5μl |
+3型Mse I引物之一(八种之一) | 5μl |
PCR Mix 3.0 | 15μl |
10.轻柔混匀后离心数秒,按下列参数进行PCR:
温度 | 时间 | |
PCR(13次) | 94℃ | 30s |
65℃ | 30s(每次循环递减0.7℃) | |
72℃ | 60s | |
PCR(13次) | 94℃ | 30s |
55℃ | 30s | |
72℃ | 60s | |
延伸 | 72℃ | 5min |
五、尿素-PAGE电泳和银染(需另购试剂并按相关说明书进行)
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名称:Aspergillosis mRNA原位杂交试剂盒
货号:ZN0098
规格:100T
基本信息:
保存条件:4℃保存一年
工作量:100张切片。
有效期:一年。
适用种属:human
标记方式:3’—尾段标记
试剂盒中内容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.预杂交液 2ml;
3.Aspergillosis mRNA原位杂交试剂盒寡核苷酸探针杂交液 2ml;
4.封闭液 5ml;
5.生物素化鼠抗地高xīn 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化过氧化物酶 5ml。
用户自备试剂:
原位杂交专用盖玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位杂交用 PBS)
一.培养细胞和冰冻切片
准备工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6H8O7•H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H5O7Na3•2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸馏水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
原位杂交用PBS(1000ml蒸馏水加氯化钠30g,Na2HPO4•12H2O 6g,NaH2PO4•2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 20--30分钟。蒸馏水充分洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+纯甲醇50份混合,室温处理30分钟。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化5—120秒钟。有时也可以不消化。原位杂交用 PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液为1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 10分钟。蒸馏水洗涤3次。
7.预杂交:湿盒的准备——干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μι加预杂交液。恒温箱38-42℃2—4小时。吸取多余液体,不洗。
8.杂交——按每张切片20μι杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱38-42℃杂交过夜(根据杂交情况可以调节)。
9.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;37℃0.5×SSC洗涤15分钟×1次; 37℃0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×1-2次)。
10.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地高xīn:37℃ 60分钟或室温120分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
12.滴加SABC:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
13.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。
14.DAB显色:使用DAB显色试剂盒—1ml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
15.必要时苏木素复染,充分水洗。
16.酒精脱水,二甲苯透明,封片。
二.石蜡切片
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定1小时即可,较大的标本固定不要超过2小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间30-40分钟,一般不要超过1小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。30%H2O2 1份+蒸馏水10份混合,室温5-10分钟以灭活内源性酶。蒸馏水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化3--30分钟(视标本新旧、厚薄自行调整)。用户可以比较不同的消化时间,例如5分钟,10分钟,20分钟,30分钟。以找到zuì佳的消化时间。原位杂交用PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。其余步骤和冰冻切片6-16步相同。
结果观察:
Aspergillosis的细胞胞浆着色呈棕黄色。
注意事项:
由于特定的mRNA序列仅占总mRNA的少数,加上基因仅由四个碱基排列组合而成,因此原位杂交容易出现非特异性染色。通过不加探针和用阴性标本做对照,基本可以确定染色是否为特异性的。有明显的非特异性染色现象时,用预杂交液对含探针的杂交液进行稀释,一般稀释2—10倍;并应加强探针杂交后的洗涤。如果有少量的细胞核着色属于正常情况;如果出现大量的细胞核着色,往往和标本固定时间过长有关,应重新处理标本。

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