WE0136 SuperSYBR Mixtur

产品简介
SuperSYBR Mixtur的品牌是百奥莱博,是优质的核酸扩增(PCR)产品,本制品仅用于生物化学研究方面,本产品质量好,且具价格,深为用户称道,了解更多SuperSYBR Mixtur等核酸扩增(PCR)产品请联系我司咨询订购。...
产品详细介绍
特别提示:包括SuperSYBR Mixture(不含ROX校正染料)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:SuperSYBR Mixture(不含ROX校正染料)
英文名称:SuperSYBR Mixture
产品货号:WE0136
产品规格:1ml|5ml
本品是专用于染料法(SYBR Green I)实时荧光定量PCR的预混体系,浓度为2×,包含 BaldStar Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs、SYBR Green I 荧光染料和Mg2+,操作简单。主要用于基因组DNA靶序列和RNA反转录后cDNA靶序列的检测。
本品所含的荧光染料SYBR Green I 可以与所有的双链DNA结合,使该产品可用于不同靶序列的检测而不需合成特异性标记探针。其中BaldStar Taq DNA Polymerase是一种经化学修饰的、全新热启动酶,在常温下没有聚合酶活性,有效避免在常温条件下由引物和模板非特异性结合或引物二聚体而产生的非特异性扩增,酶的激活须在95℃下孵育10分钟。独特的PCR缓冲体系与热启动酶的组合,有效抑制了非特异性的PCR扩增,显著提高了PCR的扩增效率。该产品适用于无需ROX作为校正染料的荧光定量PCR仪,如:Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-rad iCyler iQ,iQ5,CFX96。
试剂盒组成:
| 组份 | 1ml | 5ml |
| 2×SuperSYBR Mixture | 1ml | 5×1ml |
| ddH2O | 1ml | 5×1ml |
产品特点
1、本产品中使用了全新热启动酶BaldStar Taq DNA Polymerase与独特的PCR缓冲体系,显著提高PCR的扩增效率,具有高灵敏度和特异性强的特点。
2、适用于荧光定量PCR检测,能够准确地对目的基因进行定量和检测。
注意事项:
1、使用前请上下颠倒轻轻混匀,尽量避免起泡,并经短暂离心后使用。
2、本产品中含有SYBR Green I荧光染料,保存本产品或配制PCR反应液时应避免强光照射。
3、避免反复冻融本品,反复冻融可能使产品性能下降。
4、本品不能用于探针法荧光定量PCR。
5、配制反应液时,请使用新的或者无污染的枪头和离心管,尽量防止污染。
操作步骤:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 2×SuperSYBR Mixture | 2 5μl | 1× |
| Forward Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Reverse Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Template DNA | 2μl | |
| ddH2O | up to 50μl |
注意:
1)通常引物浓度以0.2μM可得到较好结果,可以终浓度0.1-1.0μM作为设定范围的参考。
2)通常DNA模板的量以10-100ng基因组DNA或1-10ng cDNA为参照,因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释,以确定zuì佳的模板使用量。
3)推荐反应体系为50μl,也可以根据实际实验需求按比例扩大或者缩小反应体系。
2、PCR反应程序:
注意!本产品预变性反应必须在95℃ 10分钟下完成!
建议采用下表显示的两步法PCR进行程序设定,本程序是以ABI7500荧光定量PCR仪为例。若因Tm值较低的引物等原因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR 扩增,三步法操作步骤详见《反应条件的优化》。
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 10 min | |
| 变性 | 95℃ | 15 s | 35-40 个循环 |
| 退火/延伸 | 60℃ | 1 min | |
| 融解曲线分析 | 95℃ | 15 s | |
| 60℃ | 1 min | ||
| 95℃ | 15 s | ||
| 60℃ | 15 s |
注意:
1)本产品所采用的热启动酶须在预变性95℃、10 min条件下实现酶的活化。
2)退火温度请以60-64℃作为设定范围的参考,发生非特异性反应时,可提高退火温度。
3)本程序是以ABI 7500荧光定量PCR仪为参照设定,融解曲线分析请以所使用的荧光定量PCR仪推荐的程序进行设定。
反应条件的优化:
在荧光定量反应条件优化时,应从引物浓度、退火温度、延伸时间等方面进行考虑,以提高反应特异性和扩增效率。
1、反应特异性和扩增效率高的实验体系应具备以下条件:
1)反应特异性高:阴性对照无引物二聚体等非特异性扩增;不产生目的片段以外扩增。
2)扩增效率高:Ct值低;PCR扩增效率高,接近理论值。
2、反应条件优化方法:
1)引物浓度:通常引物浓度以0.2μM可得到较好结果,可以终浓度0.1-1.0μM作为设定范围的参考。若提高反应特异性,可降低引物浓度;若提高扩增效率,可增加引物的浓度,由此优化反应体系。
2)退火温度:建议采用两步法PCR,退火温度60℃进行反应。若提高反应特异性,可提高退火温度,以60-64℃作为设定范围的参考。若因使用Tm值较低的引物等原因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR扩增,三步法的退火温度请以56℃-64℃的范围作为设定参考。
3)延伸时间:建议采用两步法PCR,延伸时间1 min进行反应。若提高扩增效率,可尝试将延伸时间增加,或尝试三步法PCR。
注意!本产品预变性反应必须在95℃ 10分钟下完成!
三步法荧光定量PCR(本程序是以ABI7500荧光定量PCR仪为例):
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 10 min | |
| 变性 | 95℃ | 10 s | 35-40个循环 |
| 退火 | 56-64℃ | 30s | |
| 延伸 | 72℃ | 32s | |
| 融解曲线分析 | 95℃ | 15s | |
| 60℃ | 1 min | ||
| 95℃ | 15 s | ||
| 60℃ | 15 s |
注意:
1)本产品所采用的热启动酶须在预变性95℃、10 min条件下实现酶的活化。
2)无法得到理想的扩增效率时,适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度。
3)若需提高反应扩增效率,可适当增加延伸时间。
4)本程序是以ABI 7500荧光定量PCR仪为参照设定,融解曲线分析请以所使用的荧光定量PCR仪推荐的程序进行设定。
储存条件:-20℃,避免反复冻融
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名称:Babuddy超保真DNA聚合酶
货号:WE0109
规格:100U
Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase是一种快速、高扩增效率的高保真DNA聚合酶,具有5"-3"DNA聚合酶活性和3"-5"外切核酸酶活性。经过改造的Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase,其活性区域融合有一段聚合增强结构域,独特的结构大提升了保真性和延伸速度。Babuddy Super Fidelity DNA Polymerase的保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍,是普通Pfu的6倍。其延伸速率为15-30 sec/kb,成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷,大大缩短了反应时间。本品特别适合于在基因克隆实验中扩增长片段DNA,尤其在扩增>10 kb的DNA片段时,更加明显,所扩增的片段zuì长可达20kb。
本产品中包含两种PCR缓冲液,经过优化的缓冲体系使酶的应用更加广泛,即使以复杂的基因组DNA为模板,也可以保证很高的特异性和长片段的扩增。特有的PCR增强剂DMSO使GC含量高,有二级结构和重复序列的复杂模板也能得到扩增。
使用本产品扩增得到的PCR产物的3"端不带有“A”碱基,可直接克隆于平末端载体中。如需进行T/A克隆,需在PCR产物末端添加“A”后进行克隆。本产品具有延伸速度快、扩增效率高、保真性强的特点。适用于基因克隆、基因定点突变、SNP等实验。
产品特点
1、高保真性:保真性是普通Taq DNA Polymerase的50倍,普通Pfu的6倍。
2、扩增速度快:其延伸速率为15-30sec/kb,成功克服了普通Pfu酶扩增效率低、扩增速度慢的缺陷。
3、特别适合于扩增长片段:扩增的片段长度可长达20kb。
产品组成:
| 组份 | 20μl×250次(100 U) |
| Babuddy DNA Polymerase,2U/μl | 50μl |
| 5×Babuddy HF Buffer | 1.5ml |
| 5×Babuddy GC Buffer | 1.5ml |
| DMSO | 0.5ml |
| 50 mM MgCl2 | 1.5ml |
注意:本产品的5×Babuddy HF 和GC Buffer中含有7.5 mM镁离子。
活性定义:
在74℃,30分钟内,将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸性不溶物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
质量控制:
1、核酸内切酶活性检测:50μl反应体系中,10 U本酶与0.2 mM dNTPs和1μg的pUC19质粒于37℃温育4小时,<10%的pUC19质粒由超螺旋变为缺刻状态。
2、7.5 kb基因组DNA PCR扩增:50μl反应体系,1×Babuddy HF Buffer,50ng基因组DNA,1 U Babuddy DNA聚合酶,200μM dNTPs和1μM引物,30个循环PCR扩增出7.5 kb目的片段。
3、20 kb λDNA PCR扩增:50μl反应体系,5×Babuddy HF Buffer,10ng λDNA,1 UBabuddy DNA聚合酶,200μM dNTPs和1μM引物,22个循环PCR扩增出20 kb目的片段。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系
| 试剂 | 20μl反应体系 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 5×Babuddy HF Buffer | 4μl | 10μl | 1× |
| dNTP Mix,2.5 mM each | 1.6μl | 4μl | 200μM each |
| Forward Primer,10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Reverse Primer,10μM | 1μl | 2.5μl | 0.5μM |
| Template DNA | 适量 | 适量 | <250ng |
| DMSO | 0.6μl | 1.5μl | 3% |
| Babuddy DNA Polymerase | 0.2 μl | 0.5μl | 1 U/50μl |
| ddH2O | up to 20μl | up to 50μl |
注意:
1)对于复杂模板或高GC含量的模板,请使用5×Babuddy GC Buffer。
2)可选步骤:对于复杂模板,如高GC含量、带有复杂二级结构的序列,可加入本产品中提供的DMSO或其他PCR添加物,以提高扩增效率,推荐终浓度为3%,也可按照2%的浓度递增优化。由于DMSO可以降低引物的Tm值,因此若DMSO使用浓度很高,需降低退火温度。
a.模板:在50μl PCR反应体系中,DNA模板的建议用量为低复杂度模板(如质粒DNA,λDNA等)1 pg- 10ng,高复杂模板(如基因组DNA)50-250ng。
b.引物:引物浓度请以终浓度0.2-1.0μM作为设定范围的参考,推荐终浓度为0.5μM。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。
c.镁离子:镁离子浓度请以终浓度1.5-3 mM作为设定范围的参考。本产品的 5×Babuddy HF Buffer和GC Buffer中已经含有7.5 mM镁离子,可根据dNTP浓度、引物和模板来调整,由此优化反应体系。若引物或模板中有螯合剂(如EDTA)存在,则应提高镁离子浓度。若需要对镁离子浓度进行优化时,可使用本产品中提供的MgCl2按照0.5 mM浓度梯度逐步调整。
d.dNTPs:反应体系中dNTPs的浓度一般为每种200μM,使用本品时,不推荐使用dUTP和带有尿嘧啶的引物或模板。
e.Babuddy酶的浓度:Babuddy酶推荐的使用浓度为1 U/50μl 反应体系,可在0.5-2 U/50μl 反应体系之间优化酶的浓度。
2、PCR反应条件
常规三步法PCR反应:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 退火 | 45-72℃ | 10-30 s | |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
a.变性:简单模板的预变性温度为98℃,预变性时间为30 s。对于比较复杂的模板,预变性时间可延长至3分钟。
b.退火:使用本产品时,退火温度设定的基本原则是,当引物长度小于或等于20 nt时,退火温度为引物zuì低的Tm;当引物长度大于20 nt时,退火温度应在zuì低Tm的基础上以Tm+3℃退火10-30 s。当无法得到理想的扩增效率时,应以zuì低的Tm值逐步提升至模板延伸温度。对于Tm高的引物可以使用两步法PCR。
c.延伸:延伸时间应根据所扩增片段的长度和模板复杂程度设定,本产品中所包含的Babuddy DNA Polymerase扩增效率为2-4 kb/min,复杂性低的模板可用4 kb/min,复杂性高的基因组DNA模板,延伸时间则应为2 kb/min,对于一些cDNA模板,延伸时间可增加到1.5 kb/min。
d.循环次数:可根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数。
当引物的退火温度较高时,建议使用两步法进行PCR扩增:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 98℃ | 30 s-3 min | |
| 变性 | 98℃ | 5-10 s | 25-35 个循环 |
| 延伸 | 72℃ | 2-4 kb/min | |
| 终延伸 | 72℃ | 5-10 min |
储存条件:-20℃,避免反复冻融。
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