BTN130905 超级杂交液(芯片)

超级杂交液(芯片)的品牌是百奥莱博，是优质的探针标记及检测产品，本制品用于科研试验，我公司专注于探针标记及检测产品的研发、生产和供应，为您提供的超级杂交液(芯片)质量可靠，批间差小，且价格公道，热切盼望您选购我们的产品。

北京百奥莱博科技有限公司是一家专业的生物试剂销售公司。公司主要经营血清、抗原、抗体等生物试剂产品，可以为您提供专业的技术服务，以优良的价格、优质的服务、优先的理念，满足客户的各方面的需求，与国内多家企业、单位建立了良好的长期合作关系，拥有较好的企业信誉和品牌形象。 主营产品:血清、抗体、抗原、核酸提取、核酸纯化等生化试剂

特别提示：包括超级杂交液(芯片)在内，本公司的所有产品仅可用于科研实验，严禁用于临床医疗及其他非科研用途！

产品名称：超级杂交液(芯片)
英文名称：Super hybrid solution(chip)
产品货号：BTN130905
产品规格：10mL

基因芯片是将大量靶基因(DNA片段)有序地、高密度地点在玻璃片或硅片或塑料片上等载体上所形成的矩阵。基因芯片杂交一般情况下是将待测的两种样品(主要是RNA样品)分别用Cy3和Cy5两种荧光染料标记，制备成探针与芯片杂交，杂交信号用激光扫描仪检测，计算机分析检测结果，可获得类似与传统的点杂交的杂交数据，以达到快速、、高通量及平行性的分析表达谱的目的。本产品为即用型芯片专用的杂交液，可用于各种标记的探针(主要是Cy3和Cy5标记的RNA探针)跟基因芯片的杂交实验。

储存条件：低温运输，-20℃保存，有效期一年。

使用方法：
一、预杂交(下面的操作以载玻片为例)
 预杂交的主要作用是在加入标记探针之前从载玻片上洗去未结合的靶基因(靶DNA)，同时封闭载玻片表面可能与标记探针进行非特异性结合的反应性基团(如自由氨基)，从而降低非特异的背景。所有的预杂交、杂交、杂交后洗涤都在Coplin染缸或者显微镜载玻片盘等杂交盒中进行。
1.在室温下，将载玻片浸入装有本产品的杂交盒中(本产品的用量根据杂交盒的大小决定，以能够浸埋载玻片为准)。将杂交盒在42℃水浴中放置30～45分钟，无需震动。
2.在室温下用去离子水清洗载玻片数次。
3.(可选)用异丙醇(HPLC级)漂洗载玻片。
4.在加入杂交溶液之前，空气晾干或者通过离心(室温下以2000g离心5分钟，有阵列的一面朝外)干燥载玻片，将干燥后的载玻片立即用于杂交。如果载玻片干燥时间超过1小时，杂交效率可能会迅速下降。
二、杂交
1. 将等同于至少1μg polyA RNA或100μg总RNA的Cy3和Cy5标记的探针RNA混合在一起，zuì终体积约为6μL。如果没有这么多的，则需要进行RNA扩增。
2. 将6μl标记DNA和30μL本产品在塑料离心管中混合，得到杂交液。
3.(可选)将杂交液在微量离心机中10,000 g离心5分钟，然后将上清液转移到新的塑料离心管中。本步骤以去除靶序列纯化过程中带入的微量玻璃纤维和其他高分子质量的颗粒。
4. 将上清液在100℃下加热2分钟，然后在30℃水浴中冷却30秒。加热混合液可以降低背景。不要将溶液放置在冰上，因为可能会有沉淀析出。
5. 将适量的杂交溶液加到DNA微阵列上，再小心的盖上盖玻片，盖玻片和DNA微阵列之间不能有气泡。
6. 将载玻片置于一个空的移液器吸头盒的上层，下层装5mL自备的3×SSC，盖上盖子即得潮湿的环境。由于杂交是在很小的体积下进行的，在密闭的潮湿保持适当的杂交适度非常重要，过分干燥则盖玻片会粘附在DNA微阵列上，背景会很高；过于潮湿则冷凝的液体会进入盖玻片区域，降低杂交信号。
7.在42℃下将载玻片温育14~16小时。
三、杂交后的清洗
 注意在下面的所有操作过程中，一定不要让载玻片干燥。
1.杂交完毕，拆卸杂交盒。如果杂交盒是浸入水浴中的，在松开螺丝之前，仔细擦干水痕，尤其是两个半片盒子之间的水痕。
2.从杂交盒中取出载玻片，浸没于大量的0.5×SSC(含0.01 % SDS)溶液中，直到盖玻片分离。
3. 盖玻片除去后，将载玻片放到玻片夹持器上，然后浸入装有约250mL 0.5×SSC(含0.01 % SDS)溶液的避光容器中。将容器放在轨道振荡器上，并将载玻片振荡2分钟。
4. 将载玻片和夹持器一起浸入到另一个装有约250mL 0.5×SSC溶液的容器中，再次将载玻片振荡3分钟。
5. 将载玻片和夹持器一起浸入到另一个装有约250mL 0.1×SSC溶液的容器中，再次将载玻片振荡3分钟。
6. 重复上一步2次，每次清洗1分钟。
7.快速(<10秒)将载玻片和夹持器一起浸入到另一个装有约250mL 0.01×SSC溶液的容器中，立即将载玻片放到铺有3M Whatman滤纸的离心机微量滴定板夹持器中。低速离心约5分钟迅速干燥玻片。
8. 将载玻片放置在避光的盒子内直到准备扫描。(尽量在当日内进行扫描，因为随着时间的延长信号会降低)

疑难解答：
问题一：高背景(荧光或黑洞)
解决方案：对标记探针进行足够的纯化；清洗过程中操作要迅速，避免载玻片干燥；杂交溶液需要与载玻片基底相匹配。
问题二：没有杂交信号或杂交信号非常弱
解决方案：杂交过程中应该连续振荡，不应该有气泡，避免玻片变干；检查RNA的纯化和标记；更换杂交试剂。

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货号	名称	规格
BTN90605C	TdT加尾法DNAdì高辛标记试剂盒	5次
BTN130907	脱脂奶粉	50g
BTN100809	SSPE溶液，20×	250mL
KFS165	Ca2+ GPCR分析-钙离子指示探针 Fluo-2, AM	200μL
KFS176	钾离子荧光探针	1mg
KFS377	活性氧ROS检测荧光探针-DHE,红300/610	5mg
SY0559	7-氨基放线菌素D	1mg

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名称：PCR法DNA探针标记试剂盒
货号：BTN90604A
规格：5次
PCR标记的原理是用带标记的dNTP进行PCR，zuì后得到的PCR产物将带有标记，可以直接用于杂交试验。其原理示意图如下：


产品特点：
1.一站式，本试剂盒提供经过优化的试剂，不需要用户自己摸索。
2. 足够10次50μl体系的常规PCR(用于制备标记反应的模板和设置对照反应)和5次50μl体系的标记反应。
3.一次标记可以得到μg级的双链DNA探针或约700ng的单链DNA探针，足够多次杂交实验用。
4. 既可用于制备双链探针，也可以用于单链探针。
5. 90604A需自备含标记核苷酸的dNTP，90604B和90604C分别含生物素和dì高辛标记的底物。自备的标记包括fluorescein-dUTP、hydroxycoumarin-dUTP、resorufin-dUTP和aminoallyl-dUTP等。
6. 本产品得到的探针参入率一般为4-5%(每100个核苷酸中有4-5个将带有非同位素标记)，有效降低了空间阻碍，检测效果zuì佳。
7.可以用于Southern和Northern Blot、原位杂交、菌落和斑点印迹杂交等分析。

试剂盒组成：

成分	规格
2×标记专用PCR Mix	500μl
dNTP，2mM each	50μl
含Biotin-11-dUTP的dNTP	25μL(仅B有)
含DIG-11-dUTP的dNTP	25μL(仅C有)
超纯水	1ml
说明书	1份

注：标记专用PCR Mix不含dNTP。

储存条件：低温运输，-20℃保存，有效期一年。

使用方法：

一：准备工作
1. 按常规的方法设计PCR引物，使探针长度在400-800bp之间。过短则标记参入少，探针杂交信号强度减弱；过长则非特异杂交增加，背景变强。
2. 根据PCR引物优化PCR条件。
3. 由于标记的dNTP比较珍贵，所以本试剂盒不推荐以基因组DNA或其他复杂DNA为模板直接进行PCR标记，而是建议采取下述的两步法标记来提高成功率，即先制备非标记PCR产物，再以之为模板制备标记的PCR产物。
二：非标记PCR产物的制备
4. 设置50μL PCR的反应体系：

成份	用量
2×标记专用PCR Mix	25μl
dNTP，2mM each	5μl
自备的探针引物一(10pmol/μL)	1μL(10μM)
自备的探针引物二(10pmol/μL)	1μL(10μM)
自备的模板DNA	1μg基因组DNA或1ng质粒DNA
超纯水	补到50μL

5. 按已经优化的PCR参数进行PCR。
6.电泳检测和胶回收所需的PCR产物，并定量。用10 pmol引物一般能得到1μg左右的PCR产物(具体取决于PCR产物的长度)。注意：zuì好采取胶回收而不是PCR回收以避免残留引物干扰后续的标记PCR。
三：标记PCR反应(zuì好做一个不加标记的对照用于定量)
说明：在设置下面反应时，如果加一种引物，就得到单链标记的PCR产物；如果加两种引物，则得到双链标记的PCR产物。由于双链PCR探针在杂交前虽然要变性成单链后使用，但杂交时变性的双链彼此还会复性，这种复性会与探针-靶DNA杂交反应相竞争，降低杂交效率，因此强烈推荐使用单链标记的DNA探针。

成份	样品	对照
2×标记专用PCR Mix	25μl	25μl
含Biotin-11-dUTP的dNTP或 含DIG-11-dUTP的dNTP或 自备的含其他标记dUTP的dNTP	5μl	不加
dNTP，2mM	不加	5μl
双链标记：探针引物一和引物二 单链标记：探针引物一或引物二	每种50 pmol 一种50 pmol	每种50 pmol 一种50 pmol
上步胶纯化所得PCR产物 (单链标记可用100ng)	10 ng	10 ng
超纯水	补到50μL	补到50μL

 注意：本试剂盒提供的dNTP混合物中，标记底物与非标记底物的比例已经进过优化，如果自备标记dUTP，其与dTTP的zuì佳比例需要优化，标记不同，比例不同。对DIG-11-dUTP，zuì佳比例1：3；对BrdUTP，zuì佳比例为1：1。
7. 按第5步的PCR参数进行标记PCR，但需要进行下列修改：一是循环数增加到35-55个循环。由于模板为纯化后的PCR产物，探针对扩增长度完整性要求不高(长度不均的探针由于能形成网络结构，效果反而更好)，所以可以增加循环数；二是延伸时间增加15秒，因为标记dUTP参入到DNA的速度比常规的dTTP慢；三是降低复性温度5-7℃，因为标记核苷酸参入到DNA后，新模板的Tm值将降低。
8. 标记探针的定量：取标记反应和对照反应的产物1-5μl，在琼脂糖凝胶上跟浓度已知的DNA marker一起电泳，并判断探针的浓度。由于标记反应的PCR产物中额外带有非同位素的配体(生物素，dì高辛等)、因此其泳动速度将慢于非标记PCR产物(但同位素标记不能用此法)。
 注意：如果扩增的是单链DNA探针，其结合EB的能力远低于双链DNA(EB是嵌合到双链碱基对之间的，而单链DNA没有碱基对，只有一些局部区域折叠形成的有限双链区，因此能结合的EB很少)，因此EB染色的强弱不能准确反应DNA的浓度，可以采用银染定量(跟marker比较)。一般100ng模板按上述条件经过单链PCR扩增可得到700ng左右探针。
9. 剩余的PCR标记产物可以不经过纯化，直接加入(对单链PCR探针)杂或加热变性并急冷后加入(对双链PCR探针)到杂交液中使用。如果暂时不用请放-20℃长期保存。如果需要纯化，请使用乙酸铵/乙醇沉淀法。

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