特别提示:包括粪便RNA柱式提取试剂盒在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:粪便RNA柱式提取试剂盒
英文名称:Fecal RNA column Extraction Kit
产品货号:BTN101109
产品规格:50次
由于粪便中有机质含量丰富,对RT-PCR等后续反应有大的抑制作用,所以从粪便中提取高纯度的RNA一直是十分棘手的问题。本产品是在粪便RNA提取试剂盒基础上开发的柱式粪便RNA提取产品。
试剂盒特点:
1. 操作比非柱式法更加简单快速,处理一个样品只需要约十几分钟。
2. 去污染效果好,RNA 纯度更高,平均OD260/280一般都在2.0左右。
3. 得到的RNA可直接用于RT-PCR、Northern杂交、cDNA 合成等实验。
4. 高于进口的柱式粪便RNA提取产品。
5. 试剂无害,环保。
试剂盒组成:
成分
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规格
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溶液A
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50ml
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酸洗玻璃珠,400μm
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25g
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溶液B
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15ml
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溶液C
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50ml
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离心吸附柱
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50套
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通用洗柱液
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50ml
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RNA洗脱液
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10ml
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说明书
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1份
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储存条件:常温运输和保存,有效期两年。
使用方法:
1.在自备的3-5mL离心管中称取0.5-1 g 粪便,加入0.5g 玻璃珠和1mL溶液A,盖紧离心盖后震荡器上剧烈震荡5-10分钟。注意:如果放置在低温,溶液A可能会产生沉淀,使用前必须放在65℃水浴使沉淀彻底溶解并充分摇匀后再取用。
2. 稍微静置后将上清液(一般呈棕色)转移至一个干净的1.5mL塑料离心管中。所取上清液不要超过1mL,否则后续操作没有足够空间。
3.在离心管中加入0.3mL的溶液B和0.2mL自备氯fǎng,在振荡器上振荡30秒混匀。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。
4.室温12000rpm离心3~5分钟。
5. 将上清液(约0.6mL)转移到另一干净的1.5mL塑料离心管中,下层有机相和中间层含有DNA、蛋白质和其他杂质,避免触及或吸取。zuì好留下100μl上清液不取。
6.在上清液中加入等体积的溶液C,用手上下颠倒或振荡器振荡30秒混匀,此时溶液呈均匀的乳浊状。
7.室温12000rpm离心3分钟,两相间将有白色膜状物(蛋白质)形成。
8. 将一半的溶液转移到离心吸附柱中,套入收集管中厚12000rpm室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
9. 将剩下的一半溶液转移到同一离心吸附柱中,套入收集管中后12000rpm室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
10. 加0.7mL 通用洗柱液,套入收集管中后室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
11. 加0.3mL 通用洗柱液,套入收集管中后室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。此步可以省略。
12. 将离心吸附柱套入收集管中后室温离心半分钟,弃含穿透液的收集管。此步干甩十分重要,否则残留的乙醇会影响RNA的使用。
13. 将离心吸附柱套入到一个自备的RNase-free 收集管中,加入30-100μL RNA洗脱液,室温放置1-2分钟。
14. 12000rpm室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
15. RNA 完整性的电泳检测:如果需要做Northern杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行RNA电泳,因为非变性胶不能分离所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。
16. RNA产量产率测定:将5-10μl RNA 溶于TE缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在OD260的光吸收。通过光吸收可以得出RNA浓度(1OD260的RNA=40μg/mL),进而计算出RNA的产量(浓度X 体积)和产率(RNA产量/组织用量)。
17. RNA 纯度测定:无污染的总RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质污染,但一般不影响RT-PCR等反应。
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名称:植物RNA提取专用高盐溶液
货号:BTN140402
规格:250mL
植物RNA溶液中常富含多糖、多酚,会阻碍和影响后续实验。本产品主要用于去除植物RNA溶液中的多糖、多酚。向已经提取的植物RNA溶液中或在使用植物RNA提取试剂盒(产品编号:BTN3080)提取植物RNA过程中加入本产品,再经过异丙醇沉淀,可以达到去除多糖、多酚的目的,得到高纯度的RNA。本产品具有下列特点:
1. 本产品不含DNase和RNase。
2. 经本产品处理后的RNA纯度高,可以直接用于Northern杂交、斑点杂交、体外翻译、RNA分解酶的保护分析、RT-PCR、构建cDNA文库等各种分子生物学实验。
3. 本产品不能用于小分子量RNA中多糖、多酚的去除,会严重影响小分子量RNA的回收率。
4.在处理微量RNA样品时,在去除多糖、多酚的同时,RNA损耗也较大,此时可以添加百奥莱博产品微量核酸沉淀剂(BTN50903)以提高回收率。
使用及效果:
取RNA样品0.5倍体积的本产品与RNA样品溶液混匀,加入等体积异丙醇,室温放置10 min,12000rpm,4℃离心10 min,弃上清。加入1mL经RNase-free水配制的预冷的75%乙醇,12000rpm,4 ℃离心5 min。弃上清,室温干燥沉淀片刻。加入适量RNase-free水或TE Buffer溶解沉淀。
名称:柱式真菌RNA提取试剂盒
货号:BTN80804
规格:50次
本试剂盒是在本公司真菌RNA提取试剂盒(BTN60305)基础上改进的柱式产品,跟真菌RNA提取试剂盒相比,它具有下列特点:
1. 柱式操作,更加简单快捷,整个过程只需要约30分钟。
2. RNA 纯度高,OD260/280一般都在2.0左右,可直接用于RT-PCR、Norther杂交、microarray hybridization、cDNA 合成等。
3. RNA产量高,一般在 20-70μg/mL 酵母培养物(约2.0 ×107个细胞)。
4. 非酶细胞破裂法,适用于各种形态和各个种属的真菌及革兰氏阳性细菌,包括 Candida albican、Saccharomyces cerevisiae、Schizosaccharomyces pombe 、 Pichia pastoris 、Bacillus subtilis、Staphylococcusaureus等。
试剂盒组成:
成分
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规格
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溶液A
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20ml
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溶液B
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25ml
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溶液C
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75ml
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溶液D
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25ml
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离心吸附柱
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50套
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通用洗柱液
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50ml
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RNA洗脱液
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10ml
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说明书
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1份
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储存条件:常温运输,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
1. 将50mg左右的干菌丝(或100mg左右的鲜菌丝、或适当数量的真菌菌落)转移到 1.5mL塑料离心管中。如果是液体真菌培养物,则直接将1-10mL液体真菌在 1.5mL塑料离心管中 12000~15000g离心 1分钟,并弃尽液体培养基(可以分多次离心)。
2. 加入0.4mL溶液A 并充分吹打混匀。如果 A溶液存放时产生沉淀,请置于65℃融化,用前充分摇晃均匀。
3. 加入0.4mL溶液B,剧烈振荡 30秒。
4. 65℃保温 5分钟。
5.室温 12000~15000g离心 3~5分钟,转移上清到一干净的1.5mL塑料离心管中。
6. 再加入0.1mL溶液B和0.1mL自备氯fǎng,振荡混匀 30秒。
7.室温 12000~15000g离心 3~5分钟,转移上清到一自备的、干净的5mL塑料离心管中。
8. 加入相当于上清 3倍体积的溶液C(约1.2-1.5mL)和1倍体积的溶液D(约0.4-0.5mL),充分混匀。
9. 将混合液(约2.5mL)分 3-4次转 移 到离 心 吸 附 柱中 。 每次13000-15000g室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
10. 用 0.5mL 通用洗柱液到离心吸附柱中,室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
11.一次洗涤一般足够去除杂质。但如果样品 OD260/280 比值不高,可以再用 0.5mL 通用洗柱液重复此步一次。
12.室温离心半分钟。此步十分重要,否则残留的洗柱液会影响 RNA的使用。
13. 将离心吸附柱转移到一自备的RNase-free 1.5mL塑料离心管中,加入30-100μL RNA 洗脱液。
14.室温离心半分钟,离心管中溶液即为RNA样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
15. RNA 完整性的电泳检测:
如果需要做 Northern杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行 RNA电泳,因为非变性胶不能分离所有的RNA分子(BioTechniques,28:414 ,2000)。 如 果是简 单 检 测 ,可以使 用 TAE或SuperBuffer-2 DNA/RNA 两用快速电泳液,但文献报道必须使用变性上样液(BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA上样液不含变性剂,也没经过去 RNase处理,所以zuì好不要使用。 尤其需要注意的是不要使用 TBE进行 RNA电泳,因为TBE 所含硼酸是研究多糖的经典方法----硼酸络合法中的关键成分,硼酸通过与RNA 核糖中的羟基发生络合反应,形成 RNA分子内或RNA分子间的络合复 合物,使同样长度的RNA 具有不同的泳动速度,电泳条带弥散,同时有大的RNA 络合复合物迟留在加样孔中(一般会误以为是基因组 DNA污染)。RNA分子内或RNA分子间的络合物的形成的多少和比例又与硼酸与RNA的数量比例有关,而 RNA样品中污染的其他多糖也会参与此反 应,使硼酸对 RNA电泳的影响更复杂,所以TBE 对 RNA电泳的影响 没有规律性和重复性。有的样品可以使用有的又不行,zuì好是避免使用。
16. RNA产量产率测定:
将5-10μL RNA 溶于TE缓冲液中(pH7.5-8.2之间)检测其在 OD260的光吸收。通过光吸收可以得出 RNA浓度(1 OD260的RNA=40μg/mL),进而计算出 RNA的产量(浓度 X 体积)和产率(RNA产量/细菌用量)。注意不要将RNA 稀释在 DEPC 水中检测 OD260和OD280,否则光吸收比在 TE中测得的低 10%-15%。
17. RNA 纯度测定:
无污染的总RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),OD260/OD230一般在2.0-2.3 之间,如果低于或高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质或多糖的污染,但一般不影响 RT-PCR等反应。蛋白质污染可以通过酚/氯fǎng抽提一次然后酒精沉淀去除,DNA和多糖污染可以分别用我公司的DNA Scavenger和PS Scavenger 去除。测 OD时 RNA 不能过度稀释使 OD 读数低于仪器的有效范围。
疑难解答:
Q:为何从酵母中提取的总 RNA 有 3 条小带?
A:它们分别是70bp左右的tRNA,120bp左右的5S RNA,160bp左右的5.8 S RNA。
Q:上样孔里的红色荧光物一定是污染的基因组 DNA吗?
A:不是。用 TAE或TBE电泳液和非变性胶电泳 RNA时容易产生此现象,百奥莱博初步研究发现大部分红色荧光物是变性不充分的单链RNA 通过碱基互补或通过硼酸络合(如果使用 TBE作电泳液的话)形成的复合物加 RNase处理后,这些红色荧光物一般会消失。为避免此现象,建议zuì好使用甲醛变性胶电泳。如果需要使用非变性胶,也必须在上样前使 RNA变性。使用百奥莱博优化的上样/变性/染色三用溶液 RNAload可以使 RNA在非变性胶上电泳时也有较好分辨率。使用非变性胶时,可以使用 TAE或超快电泳液 SuperBuffer-2,zuì好不要使用 TBE缓冲液,因为TBE中的硼酸能与RNA的多羟基形成复合物,RNA 很难形成锐利的条带。
Q:如何确认和去处除污染的基因组 DNA?
A:如果怀疑有 DNA污染,可以用 RNase处理 RNA样品,然后再电泳。如果上样孔里的红色荧光物不消失,则表示是基因组 DNA污染。进一步确认可以使用 PCR扩增法。去除污染的DNA可以使用非酶的DNA 去除剂DNA Scavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有残留的RNase污染,所以必须严格按照厂家提供的使用手册进行操作。

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