这是影响准确性和一致性的关键之一，可按照<<医院消毒卫生标准附录A（规范性附录）采样及检查方法>>等规范要求再参照生物手持式ATP生物荧光检测仪使用说明书采样、检测、计算得出结果并记录报告。采样：（面积类）将ATP拭子采样棒一支在物体表面或双手指曲面从指跟到指端来回涂擦个两次（一只手涂擦面积约30cm2），并随之转动采样拭子。（体积类）将ATP拭子采样棒一支在待测液体充分浸湿。检测：将拭子放入手持ATP仪，获得被测样本与细菌污染程度相对应的ATP生物荧光值，得出菌落数指标（详见下文操作步骤及定标评价）。另外天隆牌ATP仪自带的专用软件能自动将ATP荧光值储存、处理和传输。