空气微生物采样器能够模拟人体呼吸道解剖结构和空气动力学生理特征，利用惯性撞击原理，将悬浮在空气中的微生物颗粒按一定的等级收集起来，然后进行培养和微生物学分析。空气微生物采样器的选型一般要考虑空气微生物采样器的性能、取样目的和空气环境类型。
  (1)不同类型空气微生物采样器的性能差异较大，空气微生物采样器的采集效率存在佳范围。空气微生物采样器在一般情况下对小颗粒的采集效率较高。但是表面空气微生物采样器、孢子采样器、离心采样器对小颗粒的采集效率较低。
  (2)应根据取样目的选择空气微生物取样器。例如，仅仅要求空气中的细菌总数，或者要求空气中各种活体微生物的测定，或者要求所有微生物微粒的测定，或者进一步了解空气中携带微生物颗粒的粒度分布状况。根据上述不同的取样目的，确定了空气微生物采样器，该采样器是在液体介质中、固态培养基上或滤膜上收集空气微生物的。
  (3)空气环境类型试验结果表明，不同环境空气类型、不同地点（有无污染源）、不同时间、季节、气候条件等条件下，空气微生物的种类和污染程度存在较大差异。空气中的微生物颗粒大小不一，差异较大。细菌0.5~1.0μm，真菌3~100μm；多数真菌孢子粒径为1~5μm，病毒为0.01~0.1μm。
  室内空气中可吸菌颗粒数（CFU/m3）占空气中可吸菌颗粒数的50%~90%。当空气中微生物污染严重时，应考虑使用不易或不易超负荷的取样器。