WH0206 单索引接头(Illumina)

产品简介
单索引接头(Illumina)由专业试剂供应商北京百奥莱博提供,用于科研试验,单索引接头(Illumina)是我司众多优质基因结构和功能之一,质量堪比同类进口产品,价格非常优惠,目前正热烈促销中,恭候您的咨询订购。...
产品详细介绍
特别提示:包括单索引接头(Illumina)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:单索引接头(Illumina)
英文名称:Single-Indexed Adapter
产品货号:WH0206
产品规格:12×40μl|12×40μl|24×40μl
本制品是专门针对于illimina高通量测序平台所开发的DNA接头。可用于illimina高通量测序平台下DNA和RNA文库的构建。试剂盒分为12种接头和24种接头两种形式,每种接头均含有的6碱基index序列(barcode),以便于在多样品混合测序时进行不同样品的区分。
本制品提供的接头浓度为30μM,操作时的用法随着建库所用试剂盒、初始DNA处理量和DNA片段大小的不同而不同,具体信息请参考使用方法。另外,24种接头的Index序列详见接头序列信息部分。
产品特点:
·选择方便:分为setA和SetB两组提供24种单Index标记,可根据需求自由选择。
·使用方便:试剂盒中配备接头稀释液,稳定性强,直接用于接头溶液稀释。
·质量控制:批次间经严格质量控制和功能验证,保证index序列准确性。
适用范围:
1.本产品在二代测序(NGS)应用中,用于illimina高通量测序平台下DNA和RNA文库的构建;
2.本产品的具体应用包括:外显子测序,靶向测序,RNA-Seq,ChIP-Seq,以及定向测序和全基因组测序;
3.需要注意的是,本产品不适用于Illumina HiSeq XTM仪器及与甲基化相关的测序。
产品组成:
组分 | WH0206-A | WH0206-B | WH0206-AB | |
Single-Indexed Adapter(30μM) | 12×40μl | 12×40μl | 24×40μl | |
Adapter Dilution Buffer | 5×1.8ml | 5×1.8ml | 10×1.8ml |
保存条件:-25℃~-15℃下保存,保质期一年。
Adapter Dilution Buffer成分:10mM Tris-HCl,10mM NaCl,1mM EDTA,pH8.0~8.5@25℃。
注意事项:(请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项)
1.使用过程中,建议将BaiSeq Single-Indexed Adapter置于冰上或冰盒中,而不要置于25℃以上的环境中,以免破坏接头的结构;
2.如需对接头进行稀释,请使用试剂盒自带的Adapter Dilution Buffer,而不要使用超纯水或者其他Buffer;
3.稀释后的接头zuì好在一天内用完,不建议将稀释后的接头长期保存或反复冻融;
4.实验耗材应保证无核酸酶和核酸污染,并尽量选择低核酸吸附性的耗材进行实验。另外,在实验过程中要注意避免接头之间的交叉污染。
兼容我司文库构建产品:
1.DNA Library DirectFast Co
2.DNA Library Fast Co
3.DNA Library Co
操作步骤:
1.如果稳定Single-Indexed Adapter在连接体系中的加入量为5 μl的前提下,那么根据初始DNA处理量和DNA片段大小的不同,接头的工作液浓度如下表所示:
DNA处理量 | 不同片段大小下的工作液浓度 |
Adaper:Insert (摩尔比) | ||
200bp | 300bp | 400bp | ||
1μg | 15μM | 10μM | 7.5μM | 10:1 |
500ng | 19μM | 12.5μM | 9.5μM | 25:1 |
250ng | 15μM | 10μM | 7.5μM | 40:1 |
100ng | 15μM | 10μM | 7.5μM | 100:1 |
50ng | 15μM | 10μM | 7.5μM | 200:1 |
25ng | 7.5μM | 5μM | 3.75μM | 200:1 |
10ng | 3μM | 2μM | 1.5μM | 200:1 |
5ng | 1.5μM | 1μM | 750nM | 200:1 |
2.5ng | 750nM | 500nM | 375nM | 200:1 |
1ng | 300nM | 200nM | 150nM | 200:1 |
0.25ng | 75nM | 50nM | 37.5nM | 200:1 |
2.使用我公司相关文库构建产品时(WH0203,WH0204和WH0200),根据相关产品的DNA处理量范围,按上表进行接头母液的稀释。
3.当使用其他公司文库构建产品时,若DNA处理量大于1μg,则按接头与插入片段摩尔比10:1的标准进行接头稀释;若DNA处理量小于0.25ng,则按接头与插入片段摩尔比200:1的标准进行接头稀释;而处理DNA的摩尔数按以下公式进行计算:

4.当处理DNA片段大小在表中也没有体现的情况下,处理DNA的摩尔数也按上述公式进行计算。
接头序列信息
本产品接头序列包括如下信息:
1.Universal Sequence
5"-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3′
2.Index Including Sequence
5"-GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC[index1-27]ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3"
3.Index编号和序列
WH0206-A | WH0206-B | ||
Index | Sequence | Index | Sequence |
1 | ATCACG | 13 | AGTCAA |
2 | CGATGT | 14 | AGTTCC |
3 | TTAGGC | 15 | ATGTCA |
4 | TGACCA | 16 | CCGTCC |
5 | ACAGTG | 18 | GTCCGC |
6 | GCCAAT | 19 | GTGAAA |
7 | CAGATC | 20 | GTGGCC |
8 | ACTTGA | 21 | GTTTCG |
9 | GATCAG | 22 | CGTACG |
10 | TAGCTT | 23 | GAGTGG |
11 | GGCTAC | 25 | ACTGAT |
12 | CTTGTA | 27 | ATTCCT |
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名称:Actinin/Skeltal Muscle mRNA原位杂交试剂盒
货号:ZN0019
规格:100T
基本信息:
保存条件:4℃保存一年
工作量:100张切片。
有效期:一年。
适用种属:human,rat,mouse
标记方式:3’—尾段标记
试剂盒中内容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.预杂交液 2ml;
3.Actinin/Skeltal Muscle mRNA原位杂交试剂盒寡核苷酸探针杂交液 2ml;
4.封闭液 5ml;
5.生物素化鼠抗地高xīn 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化过氧化物酶 5ml。
用户自备试剂:
原位杂交专用盖玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
缓冲液(3%柠檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位杂交用 PBS)
一.培养细胞和冰冻切片
准备工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%柠檬酸——100ml蒸馏水中加柠檬酸(C6H8O7•H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸馏水中加氯化钠17.6g,柠檬酸三钠(C6H5O7Na3•2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸馏水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸馏水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸馏水即可。
原位杂交用PBS(1000ml蒸馏水加氯化钠30g,Na2HPO4•12H2O 6g,NaH2PO4•2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及时固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC处理,以抑制RNA酶对mRNA的分解作用。此外,过度固定对原位杂交有明显的不利影响。
1.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.细胞在多聚赖氨酸处理的盖玻片上进行培养,条件为37℃和5%的CO2,所用培养基为Dulbecco基础培养基。细胞长好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分钟×3次。
3.培养细胞和冰冻切片均可用下述方法固定:固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 20--30分钟。蒸馏水充分洗涤,干燥后-20℃冰冻可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+纯甲醇50份混合,室温处理30分钟。蒸馏水洗涤3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化5—120秒钟。有时也可以不消化。原位杂交用 PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液为1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室温固定 10分钟。蒸馏水洗涤3次。
7.预杂交:湿盒的准备——干的杂交盒底部加20%甘油20ml以保持湿度。按每张切片20μι加预杂交液。恒温箱38-42℃2—4小时。吸取多余液体,不洗。
8.杂交——按每张切片20μι杂交液,加在切片上。将原位杂交专用盖玻片的保护膜揭开后,盖在切片上。恒温箱38-42℃杂交过夜(根据杂交情况可以调节)。
9.杂交后洗涤:揭掉盖玻片,37℃左右水温的2×SSC洗涤5分钟×2次;37℃0.5×SSC洗涤15分钟×1次; 37℃0.2×SSC洗涤15分钟×1次(如果有非特异性染色,重复0.2×SSC洗涤15分钟×1-2次)。
10.滴加封闭液:37℃30分钟。甩去多余液体,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地高xīn:37℃ 60分钟或室温120分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
12.滴加SABC:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×3次。勿用其它缓冲液和蒸馏水洗涤。
13.滴加生物素化过氧化物酶:37℃20分钟或室温30分钟。原位杂交用PBS洗5分钟×4次。
14.DAB显色:使用DAB显色试剂盒—1ml蒸馏水加显色剂A,B,C各一滴,混匀,加至标本上。一般显色20-30分钟。若无背景出现则可继续显色。也可自配DAB显色剂后显色。充分水洗。
15.必要时苏木素复染,充分水洗。
16.酒精脱水,二甲苯透明,封片。
二.石蜡切片
如果有条件的话,应尽可能地采用新鲜标本。标本离体后,及时予以固定。固定液为4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。标本较大时用刀片切成厚度不超过4mm的小块,固定1小时即可,较大的标本固定不要超过2小时。某些组织对过度固定尤其敏感,如动物大脑,固定时间30-40分钟,一般不要超过1小时。
1.常规脱水、浸蜡、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的处理:一般采用多聚赖氨酸或APES。
3.石蜡切片经常规脱蜡至水。30%H2O2 1份+蒸馏水10份混合,室温5-10分钟以灭活内源性酶。蒸馏水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%柠檬酸新鲜稀释的胃蛋白酶(1ml 3% 柠檬酸加2滴浓缩型胃蛋白酶,混匀),37℃或室温消化3--30分钟(视标本新旧、厚薄自行调整)。用户可以比较不同的消化时间,例如5分钟,10分钟,20分钟,30分钟。以找到zuì佳的消化时间。原位杂交用PBS洗3次×5分钟。蒸馏水洗1次。其余步骤和冰冻切片6-16步相同。
结果观察:
Actinin/Skeltal的细胞胞浆着色呈棕黄色。
注意事项:
由于特定的mRNA序列仅占总mRNA的少数,加上基因仅由四个碱基排列组合而成,因此原位杂交容易出现非特异性染色。通过不加探针和用阴性标本做对照,基本可以确定染色是否为特异性的。有明显的非特异性染色现象时,用预杂交液对含探针的杂交液进行稀释,一般稀释2—10倍;并应加强探针杂交后的洗涤。如果有少量的细胞核着色属于正常情况;如果出现大量的细胞核着色,往往和标本固定时间过长有关,应重新处理标本。
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